PeptidomicsDB объединила более четырёх миллионов пептидных последовательностей

23 октября 2026 года в Nucleic Acids Research опубликована рецензируемая работа о PeptidomicsDB. Это открытая исследовательская база, а не испытание нового лечения.

Авторы повторно обработали по единой схеме масс-спектрометрические данные 151 проекта, включавшего 3992 биологических образца разных видов и типов. Получено более 33 миллионов записей, соответствующих более чем четырём миллионам уникальных последовательностей.

База связывает пептиды с исходными экспериментами, образцами, количественными измерениями и белками-предшественниками, где их удалось установить. Исследователь может проверить, в каких условиях обнаруживали последовательность и воспроизводилась ли находка в независимых проектах.

Более 400 тысяч последовательностей оказались похожи на известные биоактивные пептиды. Такое сходство помогает выбирать кандидатов для экспериментов, но не подтверждает одинаковую функцию или лечебное действие.

Важное ограничение: 55,5% уникальных последовательностей встретились только в одном образце, а 79,2% лишь в одном проекте. Единая вычислительная обработка не устраняет различия в подготовке материала и оборудовании. Некоторые фрагменты могли образоваться уже после взятия образца.

Ценность работы в возможности повторно использовать разрозненные данные и отбирать находки для проверки. Число записей нельзя трактовать как количество новых лекарств: биологическую функцию, безопасность и возможную медицинскую пользу каждого кандидата предстоит устанавливать отдельно.

Первоисточник: Nucleic Acids Research, PeptidomicsDB.